地球聯邦與吉翁公國的戰爭結束後7年。宇宙世紀0087年，地球聯邦組織了菁英部隊「迪坦斯」，開始追捕吉翁殘黨。然而迪坦斯卻包藏了將地球聯邦掌握手中的可怕企圖！另一方面，反聯邦組織「幽谷」的思想開始逐漸擴大。而「紅色彗星」夏亞居然身在其中？

　　當兩者相遇之際，新的傳說於焉誕生──

　　永遠的傑作「機動戰士鋼彈」續篇，衝擊登場！