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稿本七卷裝訂七冊，用紙毎半葉高21.1釐米，幅16釐米，框郭整備。每冊三十或四十葉。每半葉十行，每行二十一字，與森立之《神農本草經》相同，原文朱墨雜書，陶弘景注文非小字而改行低一字書寫。題簽“本草經集注”。 各卷分類：卷一“序目”，僅載“序錄”，無目錄。卷二以下各論，玉石、草木上、草木中、草木下、蟲獸、果菜米食及有名無用等，各成一卷，每卷首載藥品目次。 此稿本內容，乃小島尚真、森立之等考求歷代本草輯佚而成。嘉永四年六月至十二月之間，于曲直瀨氏懷仙樓，由井口榮春、井上榮三、矢島玄純、鹽田敬齋、森約之等分擔謄寫。
此書為原系羅振玉舊藏，後其孫羅繼祖將書捐贈給滿洲醫科大學，複流入東瀛，現藏于京都大學人文科學研究所。 江戶末期本草復古事業，始于狩穀掖齋《神農本草經》輯成，歷經小島寶素復原《新修本草》、小島尚真及森立之等復原《集注本草》，最終森立之完成《神農本草經》，其成果聞名於世。中國繼明末盧複之後，清代孫星衍、顧觀光、姜國伊、黃奭、王闓運等先後輯成《神農本草經》，但皆非可與森立之本相媲美。此事實中國方面亦早已認同，如葉德輝《郋園讀書志》卷六激賞雲“日本森立之所輯，引證博而且精。取校群書，多吾國未有之佚書古本，非獨孫輯無此謹嚴，即顧輯亦無此精確。
顧序謂天之未喪斯文，惟此足以當之矣”。楊守敬讚賞曰“引證博，抉擇精，遠出孫顧二本之上”。即如此徹底研究古本草，於中國亦無前例。森立之於歷代學術基礎之上創立優異成績，乃學術發展之必然。如是承前啟後，結成碩果，當視為江戶考證學最後之光彩。 時經五年，承國家新聞出版總署古籍整理出版項目資助，並獲日本北裡研究所小曾戶洋教授、天野陽介研究員，茨城大學真柳誠教授等全力協作，《本草集注》得以彩色影印出版，可謂《本草》文獻學研究者之福音。並編譯岡西為人所撰論文內容，代為解題。
